La fuerte radiación generada por los objetos HH impregna las nubes moleculares en las cuáles están embebidas, alterando significativamente la composición química de las regiones más cercanas a estos objetos. El estudio de estas regiones "iluminadas" por los objetos HH no sólo nos permite conocer cuáles son sus propiedades químicas y físicas, sino que también nos proporciona información valiosa de las nubes moleculares oscuras. Paralelamente y de manera complementaria estamos estudiando las nubes moleculares oscuras en regiones no perturbadas por la formación estelar a partir de observaciones a alta resolución.